Учёные из ИТМО представили алгоритм, который ускоряет создание лекарств от аутоиммунных болезней. Они используют машинное обучение, чтобы искать ингибиторы белка Syk, связанного с иммунной тромбоцитопенией. В итоге их метод выявил более сотни потенциальных молекул. Об этом «Жуковский.Life» рассказали в пресс-службе университета. Результаты уже опубликовали в Journal of Cheminformatics.
Этот белок Syk важен для работы иммунных клеток и развития аутоиммунных заболеваний, таких как иммунная тромбоцитопения. Для лечения применяются ингибиторы Syk, которые подавляют активность белка и помогают справляться с симптомами. Но, к сожалению, не все существующие препараты безопасны и эффективны, поэтому учёные ищут новые решения. Обычно исследования в лабораториях могут тянуться годами, но ИИ помогает сделать это быстрее.
Команда из Центра искусственного интеллекта в химии ИТМО предложила метод, который сочетает машинное обучение и генерацию молекул. Они использовали алгоритм FREED++, чтобы искать ингибиторы Syk, обучив его на базе данных ChEMBL с 3176 молекулами. Это позволило быстро создавать соединения с нужными свойствами и находить новые молекулы.
Учёные определили 139 перспективных кандидатов на ингибиторы Syk, которые, по их мнению, обладают высокой активностью и меньшими побочными эффектами. В будущем они планируют проверить их действие и безопасность, а также применить этот метод для поиска ингибиторов других целей, например, для офтальмологических препаратов и антибиотиков.
«Наш метод сочетает моделирование QSAR и обучение с подкреплением, что позволяет создавать эффективные молекулы с минимальными побочными эффектами. Совсем скоро наши молекулы пройдут лабораторные тесты, и мы надеемся, что они заинтересуют фармацевтические компании и станут основой для новых лекарств от аутоиммунных болезней», — рассказала первый автор статьи и студентка ИТМО Мария Завадская.
Ранее сообщалось, что борнеол может быть оружием против респираторно-синцитиального вируса. В своих экспериментах учёные заражали 70 мышей и давали им борнеоловые эфиры и рибавирин в течение пяти дней.