Исследователи японского института RIKEN разработали метод, позволяющий с высокой точностью определить предрасположенность человека к раку печени. Как сообщает Medical Xpress, ключевым маркёром стал белок MYCN, а анализировать риски учёным помогает алгоритм машинного обучения.
Ежегодно от гепатоцеллюлярной карциномы (самого распространённого типа рака печени) в мире умирает более 800 тысяч человек. Высокая смертность связана с поздней диагностикой: болезнь часто находят уже на последних стадиях, а вероятность рецидива достигает 80%.
Команда под руководством Сянь-Ян Циня из Центра интегративных медицинских наук RIKEN сосредоточилась на изучении белка MYCN. Учёные внедрили этот ген в геном мышей с помощью гидродинамической инъекции и выяснили: у 72% особей, у которых одновременно работали гены MYCN и AKT, в течение 50 дней развивались опухоли, полностью идентичные человеческим.
С помощью пространственной транскриптомики исследователи составили карту микроокружения опухоли и нашли кластер из 167 генов, активирующихся ещё до появления рака. Этот кластер назвали «нишей MYCN». На его основе создали модель машинного обучения, которая оценивает риски с точностью 93%.
«Мы разработали клинически применимую стратегию выявления пациентов из группы риска путем анализа экспрессии генов в неопухолевых тканях печени, — объясняет Цинь. — Объединив пространственную транскриптомику с машинным обучением, мы разработали шкалу MYCN, которая позволяет прогнозировать риск рецидива и выявлять предраковые микросреды, предрасположенные к онкогенезу в печени».
При расчёте показателя ниши MYCN у людей выяснилось, что пациенты с высокими значениями чаще страдают от рецидивов и имеют худший прогноз. Особенно показательным был анализ не самой опухоли, а здоровых тканей рядом с ней. Учёные планируют продолжить изучение биологических механизмов, создающих «благоприятную» для рака среду.
Ученые уверенно утверждают, что питание напрямую связано с развитием онкологических заболеваний. Как сообщала интернет-газета «ЖУК», простое сокращение белка в рационе может снизить риск развития рака печени или замедлить его прогрессирование у людей с нарушениями функции печени.